Астрономия и микроскопия

Форум сайта "Два Стрельца"
Текущее время: 01 авг 2025, 10:37

Часовой пояс: UTC + 3 часа




Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 4518 ]  На страницу Пред.  1 ... 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297 ... 302  След.
Автор Сообщение
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 03:12 
Не в сети

Зарегистрирован: 09 апр 2014, 23:33
Сообщения: 2145
Откуда: Хабаровск - СПб
PCPshnik писал(а):

Те статьи, что я нашёл, там состав фиксатора был из доступных и дешёвых компонентов. Где товарищ ИНО, например, морфин возьмёт?)))

_________________
Микмед-2, Бимам, Биолам


Вернуться к началу
 Профиль  
 

СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 03:16 
Не в сети
Модератор

Зарегистрирован: 08 мар 2021, 14:05
Сообщения: 198
Откуда: Краснодар
Microbiologist писал(а):
...товарищ ИНО морфин возьмёт?)))

"Кто ищет - тот всегда найдёт"(с)
Это же я к примеру, что бы направление подсказать - анестезия. Она, кстати (по идее) - обратимая (по крайней мере для исследователя при ошибке... зачастую... но бывают исключения). В отличие от тетраоксида осмия. :D

_________________
МЛ-3 + ОЛК-2 + ФМЭЛ-1.
Биолам И. Микротом-криостат МК-25. Ультратом Tesla.
Иммунология. Герпетология.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 04:50 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 25 сен 2023, 01:39
Сообщения: 2264
Да я уж понял, что господин Майкробай подбором фиксаторов хочет меня или отравить. А между тем фоток инфузорий отменного качества в Сети тьма. И делают их в том числе не профессиональные биологи, а просто любители микрофотографии. Вряд ли у них есть тетроксид осмия и там паче морфин. А холод, как я уже писал, работает неудовлетворительно. Мало того что не замирают до конца или в шарик сворачиваются, так еще и отогревается мигом, так что эффект мимолетен.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 10:30 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 20 мар 2017, 15:18
Сообщения: 2424
GraY25 писал(а):
Odal писал(а):
Объектив очень понравился!

Я тестировал эту линейку (Zeiss GF) в т.ч. 50х0.90 планАпо, на который были большие надежды, однако и он особо ничем не запомнился.
Разрешение вроде своё выдаёт но картинку сложно назвать попиксельно-резкой.
Приходится для смотрибельности уменьшать масштаб.
Плюс около-нулевой ГРИП.. Делать нано-стеки? Так себе развлечение. А по живым объектам вообще невозможно.
Для рабочих целей наверное норм, но не для получения красивых картинок. Не стал себе оставлять.


Если действительно реализовывать такие апертуры, то "попиксельной резкости" и не будет - нормальная резкость возможна при умеренном оверсемплинге или вовсе без оного, что требует весьма крупного пикселя, но "попиксельные" границы деталей объекта - почти всегда обозначают, что полностью у нас не реализована разрешающая. Дифракционное размытие при почти предельных апертурах тоже никто не отменял, так что тут всегда будут компромиссы.

ГРИП действительно мал, но иногда бывает нужда в высоком разрешении, так что опять-таки "нет в мире совершенства")) Для моих прикидок и целей на будущее - он меня весьма устраивает.
Тем более, что я слабо представляю, что можно ещё прикупить такого е качества картинки при той же апертуре и увеличении, заплатив так немного (сравнительно).


Последний раз редактировалось Odal 02 дек 2024, 10:49, всего редактировалось 1 раз.

Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 10:43 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 20 мар 2017, 15:18
Сообщения: 2424
ИНО писал(а):
.. А между тем фоток инфузорий отменного качества в Сети тьма. И делают их в том числе не профессиональные биологи, а просто любители микрофотографии. ..


Судя по тому, что я почитал и поискал - обычно просто пользуются вспышкой.
Например, конструкцию приводят вот тут снизу страницы по ссылке:
https://www.photomacrography.net/forum/ ... t=ciliates

Но вообще, мне кажется что проблема не только в скорости съёмки - дело ещё в низком контрасте таких объектов в светлом поле и в малой ГРИП объективов.
Потому как попадаются в сети снимки снятые всего-то 1/160, которые демонстрируют прекрасную читаемость жгутиков и совершенно доступны с постоянным освещением. Благодаря чему? Видимо, тому, что используются либо дифференциально-интерференционный контраст, помимо контраста ещё и подчёркивающий "рельеф" объекта, либо фазовый контраст, который в принципе, за счёт фазового кольца всегда делает апертуру несколько меньше, что тоже увеличивает ГРИП, а жгутики видны не в пример контрастнее и чётче, нежели в светлом поле.

В конце-концов, если верить наспех собранным данным (внимательно не рыл, так как это тема "не моя" - мой интерес тут любительский чисто) - частота движений жгутиков - достигает порядка 50 колебаний в секунду. Может быть где-то когда-то и больше, но спец. литература, попавшаяся наскоро, такую цифру называет.
В конце-концов это совсем не запредельно, ведь даже видеосъёмка с частотой 60 кадров в секунду, позволяет вполне нормально различать жгутики и эти колебания, а если при этом снято не в светлом поле, а в ФК или ДИК, а объект достаточно крупный, чтобы использовать объективы не близкие предельным по апертуре, а поскромнее, у которых и ГРИП выше и дифракционное размытие слабее заметно при съёмке - то всё тем более вменяемо видно.

Так что вопрос контраста тут, как по мне - не менее важен, чем скорость съёмки.

У одного спеца наткнулся на слова, что "галогенка 100ватт - почти достаточно")) Полагаю, если имеется камера с электронным затвором, а со вспышкой связываться не хочется, то можно при кратковременном включении сильного осветителя, успеть сделать серию снимков (скорость серии 15-20 кадров в секунду, как могут некоторые камеры - как по мне, должно хватить) и не поджарить препарат. Но это не точно, надо проверять.

Кроме того, есть ведь фотокамеры современные, снимающие хотя бы Full HD cо скоростью порядка до 240 кадров в секунду - на край можно снять видео и извлечь кадры оттуда... Вообще и так немало снимков, вполне удачных, в сети, где фото с хорошо видными жгутиками- именно извлечение кадров из видео, причём часто как раз вполне обычного - 60 кадров/сек.

В общем, вариантов "на подумать" тут хватает, как обойтись без химии. Со временем руки дойдут проверить..


Последний раз редактировалось Odal 02 дек 2024, 13:25, всего редактировалось 1 раз.

Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 11:48 
Не в сети

Зарегистрирован: 27 ноя 2024, 17:44
Сообщения: 13
Откуда: Санкт-Петербург
Odal писал(а):
Первые два снимка с объективом масляной иммерсии Carl Zeiss Jena GF-Planachromat HI 100x/1.25 ထ/0.17-А. Производителем заявлялась (судя по старым документам фирмы) разрешающая способность 0,27мкм. Если делать расчёт разрешающей по критерию Рэлея, то, получается, они даже немного поскромничали: R= 0,61*λ/NA = 268.4 нанометра. Впрочем, в те времена часто расчёт делался, насколько я понимаю, не для длины волны λ = 550 нанометров, как сейчас в основном делается, а для 560 нанометров. Если пересчитать с таким значением, то получается, действительно, 0,27мкм., округлённые с 273 нанометра.

Изображение


Использовался конденсор ОИ-14. В качестве тубусной линзы Raynox DCR-150 на штативе микроскопа МББ-1А.
Камеру использовал Fujifilm X-T10 - у неё размер пикселя покрупнее (4.8мкм), чем у моего старенького самсунга (4,29мкм.), т.е. оверсемплинг не такой большой, как с ним. Поскольку Цейсс рассчитан на ТЛ F=250, то с Райноксом масштаб съёмки составил 83,3:1, что тоже благотворно сказывается на дискретизации в данной компоновке для фото. Ну и к тому же, у этой камеры нет сглаживающего фильтра, что тоже полезно для микрофотографии. Не говоря уж об электронном затворе, каковой очень пригождается при съёмке подвижных объектов.

Снимал с маслом и на конденсоре и между объективом и покровным стеклом. Одна и та же инфузория в разном ракурсе и с разной обработкой:

Изображение

С другим кадром захотелось немного поиграть, сделал ему инверсию - получилась "инфузория в небе")))

ИзображениеCiliate in inversion. 83:1

Объектив очень понравился! Кстати, не думал, что он, оказывается, подпружиненный! И, надо сказать, что этот механизм у него не идёт ни в какое сравнение с Ломо-вскими, ожидаемо. Тут, на Цейссе, он более тугой, но при том более плавный, а по ощущениям, его ход вообще больше напоминает не пружину, а гидравлику - здорово сделано!


Какой красивый Euplotes


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 12:01 
Не в сети

Зарегистрирован: 27 ноя 2024, 17:44
Сообщения: 13
Откуда: Санкт-Петербург
ИНО писал(а):
Да я уж понял, что господин Майкробай подбором фиксаторов хочет меня или отравить. А между тем фоток инфузорий отменного качества в Сети тьма. И делают их в том числе не профессиональные биологи, а просто любители микрофотографии. Вряд ли у них есть тетроксид осмия и там паче морфин. А холод, как я уже писал, работает неудовлетворительно. Мало того что не замирают до конца или в шарик сворачиваются, так еще и отогревается мигом, так что эффект мимолетен.


Если вариант с ватой Вам не подходит, а осмия нет, то есть несколько и других рекомендаций, достаточно бюджетных:
1. Соорудить аналог камеры (ака "давилки") Сковородкина.
2. Использовать какой-либо простой фиксатор, компоненты которого, обычно, есть в любой химической лаборатории. К таким смесям можно отнести, например, фиксатор Да-Фано, Кальций - формол (по Бейкеру) или жидкость Буэна. Однако, при использовании фиксаторов следует помнить, что у разных видов инфузорий может быть разная реакция на них. Какие -то клетки сильно разбухают, другие же могут попросту "лопнуть".
В подавляющем большинстве случаев в научных статьях используют фотографии как живого, так и фиксированного материала. Получить малоподвижную клетку в ряде случаев возможно просто подсушив каплю с клетками. Либо поискать клетки, которые передвигаются менее активно.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 12:07 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 20 мар 2017, 15:18
Сообщения: 2424
Miku писал(а):
Какой красивый Euplotes


Спасибо!


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 18:06 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 25 сен 2023, 01:39
Сообщения: 2264
Odal, спасибо, это больше похоже на правду, чем морфин... Все-таки, видимо самоделки со впышкой здесь рулят. Но даже если удаться подобрать доходящую вспышку и встроить ее в микроскоп, останется проблема темени при наведении. Вот если б был пульт который одновременно врубает затвор (и вспышку) и вырубает постоянный свет... Есть подозрение, что чем-то таким и пользуюстя "фотохудожники по инфузориям".

Проблем с ГРИП на инфузориях я особых не заметил. Возможно, потому что до сих про рассматривал ишь довольно мелкие виды. С другой стороны, для крупных можно употребить и объектив послабее, с меньшей апртурой. В обзщем пос равненибю с насекомыми тут проблема ГРИП остнро не стоит. Проема с низким контрастом имеет место быть, но она решаема. кстати очень неплохо справляется обычное светлое поле с максимально "жестким светом" (наподобие прямых солнечных лучей без матового фильтра). Некоторые варианты косого освещения тоже хорошо себя показали. В случае с вашими фотографиями реснички тоже были бы четко видны, если б их не размыло движением. В целом, четко контрастировать реснички - сильно меньшая проблема чем нежели их "остановить".

Относительно видеосъемки ваши рассуждения неверны. Частота кадров и длинна выдержки каждого кадра - совершенно разные вещи. По частоте кадров нельзя судить о "замораживающей способности" видео, надо смотреть именно на выдержку. Конечно выдержка не может быть длиннее продолжительности показа кадра, а вот короче - насколько угодно. Т. е. для видеоряда с 30 кадрами в секунду максимальна длина выдержки 1/30 с., что, согласитесь, кране много для запечатления быстрого движения. И даже 1/60 много, так что и видео с 60 кадрами в секунду, потенциально может быть безнадежно смазанным. Но стоит отметить, что видео, чтобы выглядеть четким, все же допускает куда больший смаз в движении мелких деталей, чем фото - такова особенность человеческого восприятия.

Так же Вы неправы относительность скорости движения жгутиков, будто бы для их "заморозки" достаточно 1/120 с. На самом деле скорость это сильно разнится, даже у одного организма в разных состояниях. Например, у эвглены зеленой порой жгутик практически останавливается, тогда можно фоткать и на 1/60. А жгутики хоанофлагеллят - просто реактивные турбины, никогда не замедляющиеся. Даже в публикациях профессионалов по этой группе редко можно встретить фотографии, где отчетливо видны жгутики, а не какой-о туманный конус вместо них. Мне, кстати, удалось их заморозить вспышкой, но только на минимальном ведущем числе, что при отсутствии точного перенаправления всего светового потока в конденсор дало весьма слабое освещение даже для объектива 40Х0,65, для 90Х1,25 получается вообще темень. Видимо, придется городить какую-то высокотехнологичную городуху, направляющую весь свет точно в цель. Но оставим это на потом, сейчас меня куда более интересуют микрофотографии насекомых слабыми объективами. Тему инфузорий я поднял исключительно по причине обнаружения на вашизс снимках той же проблемы, которая досадила в этом деле мне. В ближайшее время возвращаться к попыткам их фотосъемки не планирую. Так просто спросил с заделом на будущее.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 18:24 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 25 сен 2023, 01:39
Сообщения: 2264
Miku писал(а):
1. Соорудить аналог камеры (ака "давилки") Сковородкина.

Не знаю, что это (Яндекс по запросу "камера Сковородника" выдает какую-то дичь), но термин "давилка" настораживает. Большинство инфузорий давить никак нельзя - они от этого превращаются в бесформенную массу, при том что реснички продолжаю все так же работать. У меня есть пара видео давленных инфузорий, относительно которых я поначалу долго не мог понять, что это за уродцы такие попались, пока не пронаблюдал процесс раздавливания в динамике. Силы пружины иммерсионного объектива хватило.

Цитата:
2. Использовать какой-либо простой фиксатор, компоненты которого, обычно, есть в любой химической лаборатории. К таким смесям можно отнести, например, фиксатор Да-Фано, Кальций - формол (по Бейкеру) или жидкость Буэна. Однако, при использовании фиксаторов следует помнить, что у разных видов инфузорий может быть разная реакция на них. Какие -то клетки сильно разбухают, другие же могут попросту "лопнуть".

В том-то и проблема: "какой-нибудь" фиксатор не годится, так как вызывает какие угодно реакции, кроме желаемой (остановки движения ресничек без малейшего нарушения формы, целостности и оптических свойств клетки). Непросто тут с подбором фиксатора.
Цитата:
Получить малоподвижную клетку в ряде случаев возможно просто подсушив каплю с клетками. Либо поискать клетки, которые передвигаются менее активно.

Из этого абзаца становится совершенно ясно, что опыт работы с живыми инфузориями у вас околонулевой, и даже теоретического понимания этого дела нет. Вы даже не поняли (хотя я весьма ясно выразился), что проблема вообще не в передвижении клеток, а в двиении частьей клетки друг относительно друга. Это две большие разницы! Подсушивать каплю с живой инфузорией нельзя - осмотический шок ее разорвет. Высушивать вообще - уже тем более. Это вам не окраска бактерий по Грамму.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 21:17 
Не в сети

Зарегистрирован: 09 апр 2014, 23:33
Сообщения: 2145
Откуда: Хабаровск - СПб
ИНО писал(а):
В том-то и проблема: "какой-нибудь" фиксатор не годится, так как вызывает какие угодно реакции, кроме желаемой (остановки движения ресничек без малейшего нарушения формы, целостности и оптических свойств клетки). Непросто тут с подбором фиксатора.

А нет здесь никакой проблемы. Сначала определяете предположительный вид или хотя-бы только род инфузории. Затем анализируете литературу. Предположим, что глубокоуважаемый Odal сфотографировал инфузорию, которая относится к роду Euplotes. Далее, не выходя из дома и не посещая библиотеку идём на scholar.google.com. Поисковик выдаёт нам много статей по инфузориям именно этого рода. Например:
1. Yeo J. H., Quintela-Alonso P., Jung J. H. New record of five Euplotes species (Protozoa, Ciliophora) collected from South Korea //Journal of Species Research. – 2023. – Т. 12. – №. 3. – С. 203-211.
2. Boscaro V. et al. What Can Environmental Sequences Tell Us About the Distribution of Low‐Rank Taxa? The Case of Euplotes (Ciliophora, Spirotrichea), Including a Description of Euplotes enigma sp. nov //Journal of Eukaryotic Microbiology. – 2019. – Т. 66. – №. 2. – С. 281-293.
3. Tang D. et al. Morpholino-mediated knockdown of ciliary genes in Euplotes vannus, a novel marine ciliated model organism //Frontiers in Microbiology. – 2020. – Т. 11. – С. 549781.
Смотрим раздел "Материалы и методы" и в статье (1) находим название фиксатора - жидкость Буэна (про который, кстати вам уже сегодня написали!). То есть, по крайней мере, для инфузорий рода Euplotes можно использовать фиксатор Буэна, который по составу очень простой. В разделе "Материалы и методы" ни в одной статье никаких особых методик про фотографирование не упоминается. Из контекста статьи (1) следует, что с помощью метода ДИК наблюдали и фотографировали инфузорий без фиксации. Потому что "living specimens", по моему мнению, никак не совместимы с применением фиксатора:
"For species identification, cells were fixed using Bouin’s fluid (Coats and Heinbokel, 1982), and the infraciliature was revealed by protargol (‘Procedure A’) and ‘wet’ silver nitrate methods(Foissner, 2014). Living and impregnated specimens were studied using a stereomicroscope (Olympus SZ11, Japan) and an optical microscope (Olympus BX53) at magnifications of 40-1000×."
Отрывок из статьи (2):
"The morphological characterization of strain MaS2 was carried by differential interference contrast (DIC) microscopy using an Axioplan 2 compound microscope (Zeiss, North York, Canada) and a Zeiss Axiocam 503 color digital camera, by Chatton–Lwoff silver nitrate staining (Gallagher and Kozloff 1971) and by fluorescent microscopy on specimens kept in 8 lg/ml DAPI-infused water solution (Lessard et al. 1996).
В статье (3) я вообще не нашёл описания методики наблюдения и фотографирования живых инфузорий, нет описания ни микроскопа, ни камеры. Есть только подпись к рисунку: "Cilia in Euplotes vannus. (A) DIC image showing the ventral side of a living E. vannus cell."
Во всех трёх вышеприведённых статьях, особенно в статье (2 и 3) представлены хорошие микрофотографии инфузорий с помощью метода ДИК, которые, скорее всего, не подвергались воздействию фиксатора. Ниже для примера изображены микрофотография из статей 2 и 3.


Вложения:
Из статьи 3 (А).jpg
Из статьи 3 (А).jpg [ 225.77 КБ | Просмотров: 928 ]
Из статьи 2 (G).jpg
Из статьи 2 (G).jpg [ 163.46 КБ | Просмотров: 928 ]
Из статьи 2 (А).jpg
Из статьи 2 (А).jpg [ 163.61 КБ | Просмотров: 928 ]

_________________
Микмед-2, Бимам, Биолам


Последний раз редактировалось Microbiologist 02 дек 2024, 23:20, всего редактировалось 1 раз.
Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 22:03 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 19 авг 2020, 04:33
Сообщения: 2810
Откуда: Киев
Microbiologist писал(а):
the infraciliature was revealed by protargol

Кстати протаргол обычно можно в аптеке изготовить заказать. Но не там где только торгуют, а там где еще и готовят препараты.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 23:04 
Не в сети

Зарегистрирован: 27 ноя 2024, 17:44
Сообщения: 13
Откуда: Санкт-Петербург
proton писал(а):
Microbiologist писал(а):
the infraciliature was revealed by protargol

Кстати протаргол обычно можно в аптеке изготовить заказать. Но не там где только торгуют, а там где еще и готовят препараты.


К большому сожалению аптечный протаргол не подходит для импрегнации соматической цилиатуры инфузорий. В 2013 (или 2014) году вышла статья, где предлагается метод самостоятельного приготовления протаргола. В большинстве статей сейчас как раз используют именно такой протаргол. Либо используют другой метод импрегнации, например, "влажный" метод с использованием нитрата серебра или карбонатное серебрение.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 23:46 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 25 сен 2023, 01:39
Сообщения: 2264
Ну, про серебрение все знают. Наверное, для науки хорошо. Однако я имел в виду снимки, на которых инфузория "как живая", а может, и на самом деле живая.

Miku, я так понимаю, вы специалист по ним? Так поведайте же у вас принято фотографировать живых или "свежеубиенных"?

Microbiologist, снизошли, наконец, до цитат, да еще и с картинками вместо того, чтоб посылать через ВПН в гугль-академию (иначе в ДНР не показывает). Похвально! Жаль в тех статьях, где юез фиксатора, ничего не сказано про выдержку и свет.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
СообщениеДобавлено: 02 дек 2024, 23:53 
Не в сети

Зарегистрирован: 27 ноя 2024, 17:44
Сообщения: 13
Откуда: Санкт-Петербург
ИНО писал(а):
Ну, про серебрение все знают. Наверное, для науки хорошо. Однако я имел в виду снимки, на которых инфузория "как живая", а может, и на самом деле живая.

Miku, я так понимаю, вы специалист по ним? Так поведайте же у вас принято фотографировать живых или "свежеубиенных"?

Microbiologist, снизошли, наконец, до цитат, да еще и с картинками вместо того, чтоб посылать через ВПН в гугль-академию (иначе в ДНР не показывает). Похвально! Жаль в тех статьях, где юез фиксатора, ничего не сказано про выдержку и свет.


Вы мне льстите! Какой уж я специалист, так "околонулевой" опыт))


Вернуться к началу
 Профиль  
 
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 4518 ]  На страницу Пред.  1 ... 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297 ... 302  След.

Часовой пояс: UTC + 3 часа


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 15


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Перейти:  
Создано на основе phpBB® Forum Software © phpBB Group
Русская поддержка phpBB
Яндекс.Метрика