Дифракционный предел распространяется только на интерферирующие источники в амплитудном контрасте. В люминесценции источники независимы, и согласно законами физики - никогда не интерферируют, соответственно никакого дифракционного предела для них не существует. Это любой школьник знает.

Это все прекрасно, я немного о другом. Предположим имеются два источника, в нашем случае - 2 молекулы, расположенные друг от друга на расстоянии много меньше 0,2 мкм. Каким образом их разрешить пространственно ? Какая регистрирующая система должна применяться ?

Да какая угодно, позволяющая регистрировать их излучение отдельно. Если это 2 разные молекулы, то их спектры будут просто отличаться и их друг от друга можно разделить светофильтрами.
Если это 2 одинаковые молекулы можно использовать модулированные лазеры и стохастические методы, чтобы регистрировать их отдельно. У каждой молекулы есть вероятность перехода в возбужденное состояние и вероятность излучательной релаксации, они независимы, соответственно, существует ненулевая вероятность следующих событий: излучение обоих молекул, излучение первой молекулы, излучение второй молекулы, это импульсные процессы, которые можно регистрировать отдельно. Дальше работает математика.
Это только один из вариантов, а их море. Прочитайте на википедии, чтоли...